ArchivDeutsches Ärzteblatt17/2018Lebenswissenschaften: Neue Open-Source-Plattform für die Analyse von Big Data

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Lebenswissenschaften: Neue Open-Source-Plattform für die Analyse von Big Data

Dtsch Arztebl 2018; 115(17): A-831

Hillienhof, Arne

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Rund 900 Nutzer aus 55 Arbeitsgruppen verzeichnet die Plattform bereits, die Anfragen an den Server bewegen sich im sechsstelligen Bereich. Foto: ar130405/stock.adobe.com
Rund 900 Nutzer aus 55 Arbeitsgruppen verzeichnet die Plattform bereits, die Anfragen an den Server bewegen sich im sechsstelligen Bereich. Foto: ar130405/stock.adobe.com

Einen neuer Server namens „usegalaxy.eu“ hat die Albert-Ludwigs-Universität Freiburg in Betrieb genommen. Galaxy ist eine Open-Source-Plattform für die Analyse von Big Data in den Lebenswissenschaften, die Wissenschaftler über einen Internetbrowser benutzen können.

Galaxy wurde an der US-amerikanischen Penn State University initiiert und an der Universität Freiburg im Sonderforschungsbereich „Medizinische Epigenetik“ sowie als Teil des Deutschen Netzwerks für Bioinformatik-Infrastruktur weiterentwickelt. Der neue Europaserver befindet sich im Rechenzentrum der Universität Freiburg.

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Kenntnisse im Programmieren sind für die Nutzung von Galaxy laut den Freiburgern nicht erforderlich: Alle Einstellungen lassen sich über eine grafisch aufbereitete Oberfläche vornehmen. Das Freiburger Galaxy-Team organisiert regelmäßig Trainingskurse für Nutzer, Administratoren und Entwickler. Das Material ist kostenfrei und online zugänglich.

Die Möglichkeiten von Big Data verändern viele Forschungsprozesse in den Lebenswissenschaften grundlegend: An die Stelle überschaubarer Versuchsanordnungen treten häufig Analysen, die Hunderttausenden einzelner Experimente entsprechen. „Um in der weltweiten Spitzenforschung dabei zu sein, braucht es statistische Methoden, eine qualitativ hochwertige Datenanalyse und hohe Rechenkapazitäten“, erläuterte Dr. Björn Grüning, der das Freiburger Galaxy-Team leitet. hil

https://usegalaxy.eu/

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