SUPPLEMENT: Praxis Computer
Vergleich genetischer Daten im Internet
Dtsch Arztebl 2002; 99(45): [36]


Website der Gen-Suchmaschine unter der Adresse
http://ngfnblast.gbf.de
Ähnliche Buchstabenabfolgen in den Gensequenzen weisen oft auf eine ähnliche Funktion der Gene hin. Zurzeit gibt es drei öffentliche Gendatenbanken, die Sequenzvergleiche ermöglichen. Ihre Daten werden in den USA, Großbritannien und Japan gesammelt und abgeglichen. Eine Suche ist bisher aufwendig, weil in der Regel die passenden Gensequenzen sämtlicher in der Datenbank vorhandenen Organismen aufgelistet werden. Der NGFN-Blast greift auf diese Daten zurück, aktualisiert sie täglich, prüft sie auf Unstimmigkeiten und sortiert sie nach den gewählten Untergruppen.
Das System ist so flexibel, dass es um zusätzliche Untergruppen erweitert werden kann. So können die Datenberge aus der Genomforschung nicht nur sortiert, sondern auch interpretiert werden. EB
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